Πρόκειται για ένα από τα χαρακτηριστικότερα και πιο όμορφα φαράγγια της νότιας κεντρικής Κρήτης. Τοποθετείται στις δυτικές υπώρειες των Αστερουσίων, δίπλα ακριβώς στο Αγιοφάραγγο και νότια της Μονής Οδηγήτριας. Το μήκος του δεν ξεπερνά τα 2 χιλιόμετρα ενώ η υψομετρική διαφορά μεταξύ της εισόδου και της παραλίας του Μάρτσαλου, στην οποία καταλήγει, είναι περίπου 145 μέτρα.
Η διάσχισή του είναι σχετικά εύκολη, αν εξαιρέσει κανείς το έντονα κατηφορικό τμήμα του φαραγγιού από το σπηλαιώδη ναό της Παναγίας μέχρι την κοίτη του, όπου απαιτείται κάποια προσοχή.
Το Μάρτσαλο ξεχωρίζει για το ιδιαίτερο τοπίο, το οποίο θυμίζει περισσότερο Μέση Ανατολή παρά Κρήτη. Στην κοίτη του φύονται, μεταξύ άλλων, Φοίνικες του Θεόφραστου, αιωνόβιες ελιές, χαρουπιές, αρμυρίκια και μεγάλες πικροδάφνες. Ανάμεσά τους βρίσκει καταφύγιο πλήθος από αγριοκάτσικα, τα οποία θα συναντήσετε στη διαδρομή.
Η κοίτη του καταλήγει στην πανέμορφη, μικρή παραλία του Μάρτσαλου με το μαγευτικό, βαθύ πράσινο βυθό.