Ναυτικό Μουσείο Χανίων
Το Ναυτικό Μουσείο Κρήτης βρίσκεται στην είσοδο του ιστορικού Φρουρίου Φιρκά.
Λαογραφικό Μουσείο "Κρητικό Σπίτι"
Ιδιωτικό Μουσείο που δημιουργήθηκε με την πρωτοβουλία της Ασπασίας Μπικάκη και της Ειρήνης Κουμανδαράκη.
Αρχαιολογικό Μουσείο Ρεθύμνου
Η συλλογή του μουσείου ξεκινάει από το 1888 με την πρωτοβολία του Ελληνικού Φιλεκπαιδευτικού Συλλόγου Ρεθύμνης.
Ιστορικό & Λαογραφικό Μουσείο Ρεθύμνου
Σε ένα αναστηλωμένο βενετσιάνικο αρχοντικό του 17ου αιώνα λειτουργεί το μουσείο. Η συλλογή του μουσείου προέρχεται από δωρεές και αγορές.
Μουσείο Μονής Αρκαδίου
Το μουσείο της Μονής Αρκαδίου στεγάζει μία πολύ αξιόλογη συλλογή από εικόνες μεταβυζαντινής εποχής, αρχιερατικά άμφια, όπλα, χειρόγραφους κώδικες ακόμα και π
Μουσείο Σύγχρονης Τέχνης Κρήτης
Η Δημοτική Πινακοθήκη “Λ. Κανακάκις” ξεκίνησε τη λειτουργία της το 1992 και στεγάζεται σε κτίριο στο κέντρο της πόλης.
Μουσείο Κέρινων Ομοιομάτων Ποταμιανού
Στους πρόποδες του Ψηλορείτη βρίσκεται το Μουσείο Κέρινων Ομοιομάτων.