Έξω από το Μοναστηράκι Αμαρίου, έχει ανασκαφεί σημαντικός παλαιοανακτορικός οικισμός στο κέντρο του οποίου υπάρχει μεγάλο διώροφο κτιριακό συγκρότημα με ανακτορικά χαρακτηριστικά. Φαίνεται να κτίστηκε γύρω στο 2000 π.Χ. και να καταστράφηκε βίαια, όπως όλα τα παλαιά ανάκτορα, κατά το 1700 π.Χ. από σεισμό ή/και πυρκαγιά.
Οι ανασκαφές έχουν αποκαλύψει τις αποθήκες του, χώρους λατρείας καθώς και δωμάτια που μάλλον αποτελούσαν το αρχειοφυλάκιο του ανακτόρου, καθώς εκεί βρέθηκε μεγάλος αριθμός από πήλινα σφραγίσματα.
Τα δείγματα της κεραμικής που βρέθηκαν στον οικισμό του μοναστηρακίου μοιάζουν με αυτά της Φαιστού, γεγονός που υποδηλώνει πως τα δύο αυτά κέντρα είχαν αναπτύξει οικονομικές κι εμπορικές σχέσεις.
