Η Βιάννος διαθέτει ένα από τα πλέον εκτεταμένα δάση της Κρήτης, με κυρίαρχο είδος την τραχεία πεύκη αλλά και μεγάλες εκτάσεις με πρίνους, καθώς και συστάδες κυπαρισσιών και άλλων δασικών ειδών, όπως ο ασφένταμος, η αριά (αζίλακας) και ο ελαιόπρινος.
Ειδικότερα, στα μεγαλύτερα υψόμετρα κυριαρχούν ορεινά φρύγανα όπως η λουτσιά, χαμηλά δέντρα πρίνου και η νανοκερασιά. Στα πιο χαμηλά υψόμετρα διατηρούνται πολύ πυκνές συστάδες μακκίας (χαρουπιά, σχίνος, ασπάλαθος, σπάρτα), φρύγανων με πολλά αρωματικά είδη (ασπάλαθος, αστοιβίδες, αχινοπόδι, θυμάρι, αγκαραθιά, αντωναϊδα κ.α.) καθώς και συστάδες τραχείας πεύκης.