Το Κνωσανό φαράγγι αναπτύσσεται σε μήκος που φτάνει τα 6 χλμ. και αποτελεί ουσιαστικά τη φυσική συνέχεια του Ιερού βουνού Γιούχτα. Είναι ένα από τα τρία φαράγγια του Οικολογικού-Αρχαιολογικού πάρκου του Γιούχτα.
Ξεκινάει από τους πρόποδες του βουνού, νότια των Αρχανών και διέρχεται από τη θέση Κάτω Μύλος, τη περιοχή Μυριστή και την υδατογέφυρα της Αγίας Ειρήνη στα Σπήλια, για να καταλήξει βορειότερα κοντά στη Κνωσό.
Η υψομετρική διαφορά μεταξύ της εισόδου και της εξόδου του είναι 270 μέτρα, ενώ για να το διασχίσει κανείς δεν απαιτείται ειδικός εξοπλισμός ή ιδιαίτερη εμπειρία.